La metodologia didattica dell'UP Giordano Bruno per la Libera Scienza è modulare questo significa che ogni insegnamento verrà svolto nella sua completezza, senza prevedere una propedeuticità. Essa  permette inoltre ai nostri allievi di poter praticare immediatamente consulenze nell'ambito delle monodiscipline frequentate, al termine delle quali verrà erogato, per ognuna di esse, il relativo Attestato di Frequenza. Questo tipo di didattica consente agli allievi di potere sperimentare sin dal primo anno di corso la propria professionalità attraverso le monodiscipline, consentendo quindi non solo l'immediata applicazione delle conoscenze in campo pratico, ma anche la possibilità di percorsi di lavoro in corso di studi. Prevede l'utilizzo di percorsi didattici costituiti da learning objects (unità di contenuto didattico), in cui convergono molteplici strumenti, materiali e servizi, che agiscono in modo sinergico sul percorso di formazione ed apprendimento dello studente. Il discente, infatti, dispone:

• del testo scritto della lezione, con riferimenti bibliografici e note;
• delle diapositive (arricchite da testi, tabelle, immagini, grafici) commentate in audio dal docente;
• dei filmati delle lezioni, disponibili in modalità sincrona e/o asincrona;
• delle esercitazioni di autovalutazione per la verifica dello stato di apprendimento.

Ogni studente partecipa alle attività della propria classe virtuale, coordinata da tutor esperti dei contenuti e formati agli aspetti tecnico-comunicativi della didattica on-line, e viene seguito dal titolare della disciplina che è responsabile della didattica. L'attività di guida/consulenza è svolta attraverso la creazione di spazi virtuali interattivi sincroni ed asincroni (forum, web conference, sessioni live, etc.) o, in caso di richieste di chiarimenti personalizzati, via e-mail. Un Tutor sarà periodicamente disponibile su messenger (in date che verranno comunicate di volta in volta) per assistenza allo studio e supporto motivazionale